Simulasi Dinamika Molekul Protein Apo FKBP12
Dublin Core
Title
Simulasi Dinamika Molekul Protein Apo FKBP12
Subject
protein apo, FKBP12, simulasi dinamika molekul
Description
Abstrak. FKBP12 adalah protein reseptor immunosuppresan FK506 (Tacrolimus) dengan massa 12 kDa yang
mengikat dengan kuat transforming growth factor β-1(TGF β-1) yang terlibat dalam regulasi proliferasi dan
diferensiasi sel-sel yang diperlukan untuk penyembuhan jaringan. Penelitian ini bertujuan memahami kestabilan
FKBP12 dalam keadaan bebas (apo) dengan menggunakan simulasi dinamika molekul yang dikombinasi dengan
penambahan potential (potential flooding) untuk mendapat perubahan struktur dengan waktu simulasi yang lebih
singkat. Dengan menggunakan tiga struktur awal yang mirip diperoleh struktur akhir yang mengalami perubahan
yang cukup signifikan pada kantong pengikatannya. Hal ini menunjukkan sekalipun fleksibilitasnya cukup stabil
tanpa gangguan, tetapi dengan adanya penambahan potensial struktur apo tidak dapat mempertahankan lagi struktur lokalnya, khususnya pada rongga pengikatan
mengikat dengan kuat transforming growth factor β-1(TGF β-1) yang terlibat dalam regulasi proliferasi dan
diferensiasi sel-sel yang diperlukan untuk penyembuhan jaringan. Penelitian ini bertujuan memahami kestabilan
FKBP12 dalam keadaan bebas (apo) dengan menggunakan simulasi dinamika molekul yang dikombinasi dengan
penambahan potential (potential flooding) untuk mendapat perubahan struktur dengan waktu simulasi yang lebih
singkat. Dengan menggunakan tiga struktur awal yang mirip diperoleh struktur akhir yang mengalami perubahan
yang cukup signifikan pada kantong pengikatannya. Hal ini menunjukkan sekalipun fleksibilitasnya cukup stabil
tanpa gangguan, tetapi dengan adanya penambahan potensial struktur apo tidak dapat mempertahankan lagi struktur lokalnya, khususnya pada rongga pengikatan
Creator
Elisabeth Catherina Widjajakusuma, Ajeng Indah Puspita, Dwi Vita Setiyoningsih, Fildzah Miftaqul Dina
Source
https://prosiding.arikesi.or.id
Publisher
Asosiasi Riset Ilmu Kesehatan Indonesia
Date
Juni 2024
Contributor
Sri Wahyuni
Format
PDF
Language
Indonesian
Type
Text
Files
Citation
Elisabeth Catherina Widjajakusuma, Ajeng Indah Puspita, Dwi Vita Setiyoningsih, Fildzah Miftaqul Dina, “Simulasi Dinamika Molekul Protein Apo FKBP12,” Repository Horizon University Indonesia, accessed April 11, 2026, https://repository.horizon.ac.id/items/show/12175.